家蚕超级泛基因组图谱绘就——创建“数字家蚕”，赋能设计育种

基地科研团队完成家蚕大规模种质资源基因组解析（“千蚕基因组”），绘就家蚕超级泛基因组。该研究在世界上率先实现家蚕基因库数字化，创建“数字家蚕”，对于深化功能基因组研究和推进家蚕模式化，开启家蚕设计育种，赋能“改造家蚕、多元利用”等，将产生深远的影响。

家蚕是重要的经济昆虫和新兴模式生物，但之前仅有单一参考基因组及部分重测序，尚不足以支撑基因组变异和优良基因的深度挖掘，尤其对于分子育种具有显著局限。超级泛基因组是一个物种所有基因组信息的总和，对于深化功能基因组研究、种质创新等意义重大。

研究团队对1078份蚕种质资源（205份地方种，194份改良种，632份遗传材料，47份野桑蚕）进行了深度二代（短读长）测序，对其中545份代表性资源进行了三代（长读长）测序，产生55.57T基因组数据，组装了545个蚕的高质量基因组，对100个基因组进行了基因注释，鉴定到4300余万个SNP、930余万个Indel、340余万个结构变异（SV）和7308个新基因（家族），绘制了一个高精度家蚕泛基因组图谱。该超级泛基因组囊括了目前最全面的家蚕和野桑蚕基因组信息，是迄今全球动植物领域最大的长读长泛基因组。同时，对蚕的各种遗传变异、群体结构、人工选择和生态适应性及经济性状开展了深入的研究，取得丰硕的创新结果。研究论文“High-resolution silkworm pan-genome provides genetic insights into artificial selection and ecological adaptation”于2022年9月24日在国际名刊 Nature Communications 在线发表。